- Šabina
- Šafov
- Šakvice
- Šanov
- Šanov
- Šanov
- Šaplava
- Šaratice
- Šardice
- Šárovcova Lhota
- Šarovy
- Šatov
- Šebestěnice
- Šebetov
- Šebířov
- Šebkovice
- Šedivec
- Šelešovice
- Šemnice
- Šenov
- Šerkovice
- Šestajovice
- Šestajovice
- Šetějovice
- Ševětín
- Šilheřovice
- Šimanov
- Šimonovice
- Šindelová
- Šípy
- Široká Niva
- Široký Důl
- Šišma
- Šitbořice
- Škrdlovice
- Škvorec
- Škvořetice
- Šlapanice
- Šlapanov
- Šleglov
- Šonov
- Šonov
- Šošůvka
- Špičák - Železná Ruda
- Špičky
- Špindlerův Mlýn
- Štáblovice
- Šťáhlavy
- Štarnov
- Štěchov
- Štěchovice
- Štědrá
- Štěkeň
- Štěměchy
- Štěnovice
- Štěnovický Borek
- Štěpánkovice
- Štěpánov
- Štěpánov
- Štěpánovice
- Štěpánovice
- Štěpkov
- Štětí
- Štětkovice
- Štichov
- Štichovice
- Štíhlice
- Štipoklasy
- Štítary
- Štítina
- Štítná nad Vláří
- Štítov
- Štíty
- Štoky
- Štramberk
- Študlov
- Študlov
- Šubířov
- Šumavské Hoštice
- Šumice
- Šumice
- Šumná
- Šumná
- Švábenice
- Švábov
- Švihov
- Švihov
